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    糙皮側耳原基期差異表達基因分析


    【發(fā)布日期】:2019-01-23  【來源】:菌物學報
    【作者】戚元成張倩薛元邱立友申進文
    【機構】河南農(nóng)業(yè)大學生命科學學院
    【摘要】為解析糙皮側耳原基期與菌絲期差異表達的基因,本研究以原基期c DNA為檢測子(tester)、雙核菌絲期c DNA為驅(qū)趕子(driver),采用抑制性消減雜交法(suppression subtractive hybridization,SSH)構建了糙皮側耳SSH c DNA文庫。菌液PCR驗證SSH c DNA文庫插入c DNA片段后,挑取了2 055個差異轉化子,差異轉化子經(jīng)3次反向Northern雜交篩選,得423個信號差異顯著的克隆;陽性克隆測序后,經(jīng)NCBI數(shù)據(jù)庫Blastn和Blastx比對,共得206條差異表達序列(expressed sequence tag,EST),重復序列去除后,有46個基因參與了細胞急救和防御、能量代謝、轉錄和蛋白調(diào)控、膜蛋白和信號轉導,18個基因編碼未知功能的推定蛋白,5個無任何同源性的新基因。挑取10個差異表達基因進行半定量RT-PCR,發(fā)現(xiàn)這些序列在原基期的表達水平顯著高于菌絲期。結果表明,本研究成功構建了糙皮側耳原基期與菌絲期SSH c DNA文庫,為進一步分離糙皮側耳生長發(fā)育相關基因并研究糙皮側耳的發(fā)育機制奠定了基礎。 
    【基金】國家現(xiàn)代農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)技術體系專項資金(CARS-24); 河南省高等學校重點科研項目(13B180051); 河南省高等學校重點科研項目(14A180023)~~;
    【關鍵詞】糙皮側耳; 抑制性消減雜交cDNA文庫; 異表達基因; 反向Northern blot; 半定量RT-PCR;
     
     
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