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    草菇GH61家族基因的生物信息學分析及金屬離子對其表達水平的影響


    【發布日期】:2019-01-22  【來源】:菌物學報
    【作者】饒佳 鮑大鵬 李燕 汪瀅 程向陽 王瑩
    【機構】國家食用菌工程技術研究中心農業部 南方食用菌資源利用專業重點實驗室 上海市農業遺傳育種重點開放實驗室上海市農業科學院食用菌研究所 上海海洋大學食品科學與工程學院
    摘要:在前期工作中發現草菇含有30個GH61家族基因同源物(Vvgh611至Vvgh6130),進一步分析了這些基因的結構特點以及其編碼蛋白基本性質和系統進化關系,并研究了Cu2+和Mn2+對基因表達水平的影響。分析表明有17個草菇GH61基因串聯成6個基因簇,存在明顯的串聯重復現象,系統發育樹與基因外顯子位置分析表明串聯重復基因分布在同一進化分枝上并具有相似的基因結構,串聯重復基因編碼序列一致性在71%–94%之間。草菇GH61編碼蛋白的氨基酸數目在217–442aa之間,分子量和等電點分別介于22.4–45.4k Da和5.2–9.3之間,絕大多數都含有信號肽并定位在細胞外,都含有Glycohydro61功能域以及CBM1、peroxidase等多樣化的功能域,系統進化樹表明草菇GH61家族基因具有3個主要進化分枝,與灰蓋鬼傘等的GH61基因有較近的進化關系。金屬離子誘導作用顯示,Mn2+對草菇GH61家族基因的表達水平存在誘導作用而Cu2+的誘導作用不明顯。 還原
    基金:上海市科技人才計劃項目(13XD1424700)~~;
    關鍵詞:草菇; GH61家族; 串聯重復; 基因表達;
     
     
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