【作者】呂雪蓮 張曉利 王淼淼 佘曉東 呂桂霞 沈永年 劉維達
【機構】中國醫學科學院皮膚病研究所
摘要:分別采用rRNA基因內轉錄間隔區(ITS)和基因間隔區(IGS1)測序,ITS和IGS1區PCR限制性片段長度多態性分析(PCR-RFLP)和基因組DNA的隨機擴增多態性DNA(RAPD)等方法,對三株因肯毛孢子菌Trichosporon inkin進行分子特征及種內分型研究。結果顯示,不同菌株的rRNA基因ITS區和IGS1區的序列相似性均高達100%,RFLP酶切圖譜具有較理想的種內一致性,而不同菌株的RAPD圖譜不盡相同。研究表明:rRNA基因IGS1區測序及RFLP酶切可考慮用于因肯毛孢子菌的菌種分子鑒定,而基因組DNA的RAPD則較適合于菌種的種內分型。
基金:科技重大專項(No.2008ZX10004-002); 衛生部部屬(管)醫院臨床學科重點項目(No.2007.7); 衛生部公益性行業科研專項經費項目(No.200802032); 江蘇省自然科學基金(No.BK2008091);
關鍵詞:rRNA基因測序; PCR限制性片段長度多態性分析; 隨機擴增多態性DNA;
【機構】中國醫學科學院皮膚病研究所
摘要:分別采用rRNA基因內轉錄間隔區(ITS)和基因間隔區(IGS1)測序,ITS和IGS1區PCR限制性片段長度多態性分析(PCR-RFLP)和基因組DNA的隨機擴增多態性DNA(RAPD)等方法,對三株因肯毛孢子菌Trichosporon inkin進行分子特征及種內分型研究。結果顯示,不同菌株的rRNA基因ITS區和IGS1區的序列相似性均高達100%,RFLP酶切圖譜具有較理想的種內一致性,而不同菌株的RAPD圖譜不盡相同。研究表明:rRNA基因IGS1區測序及RFLP酶切可考慮用于因肯毛孢子菌的菌種分子鑒定,而基因組DNA的RAPD則較適合于菌種的種內分型。
基金:科技重大專項(No.2008ZX10004-002); 衛生部部屬(管)醫院臨床學科重點項目(No.2007.7); 衛生部公益性行業科研專項經費項目(No.200802032); 江蘇省自然科學基金(No.BK2008091);
關鍵詞:rRNA基因測序; PCR限制性片段長度多態性分析; 隨機擴增多態性DNA;