【作者】蘇春麗 唐傳紅 張勁松 潘迎捷

【機(jī)構(gòu)】南京農(nóng)業(yè)大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院微生物系上海農(nóng)業(yè)科學(xué)院食用菌研究所上海水產(chǎn)大學(xué)食品科學(xué)學(xué)院 南京210095上海農(nóng)業(yè)科學(xué)院食用菌研究所上海201106上海200090

【摘要】PCR分別擴(kuò)增了38個靈芝屬菌株的β-微管蛋白基因片段,并對PCR產(chǎn)物進(jìn)行序列測定,得到419bp的一段核苷酸系列。根據(jù)MEGA2.1軟件中的neighbour-joiningmethods對上述序列進(jìn)行聚類分析,結(jié)果所有供試菌株被分成9個聚類組。中國栽培靈芝菌株分布于6個聚類組,其中樹舌亞屬、紫芝組的菌株各自聚成一組,靈芝組的菌株分成四組,但大部分靈芝組菌株均聚于同一組,這表明樹舌亞屬、紫芝組和靈芝組間的遺傳差異較大,靈芝組內(nèi)雖然存在著一定的遺傳差異,但總體上親緣關(guān)系比較近,遺傳多樣性并不豐富。同時,序列分析的結(jié)果顯示,β-tubulin基因序列在第三位密碼子和內(nèi)含子部位有高的堿基替換率,這些變異提供了豐富的系統(tǒng)發(fā)育信息,提示β-tubulin基因適合于靈芝屬菌株的親緣關(guān)系研究。 

【基金】上海市農(nóng)委重點(diǎn)攻關(guān)項目(No.農(nóng)科攻字2002-1-4-3)；

【關(guān)鍵詞】序列分析; neighbour-joiningmethods; 聚類分析; 遺傳多樣性;