【作者】 杜慕云； 楊仁德； 李劍； 謝寶貴； 

 

【Author】 DU Muyun;YANG Rende;LI Jian;XIE Baogui;Guizhou Soil and Fertilizer Institute;Mycological Research Center of Fujian Agricultural and Forestry University;

 

【機(jī)構(gòu)】 貴州省土壤肥料研究所； 福建農(nóng)林大學(xué)菌物研究中心； 

 

【摘要】 基于草菇(Volvariella volvacea)基因組和轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),通過(guò)生物信息學(xué)的方法對(duì)草菇α-淀粉酶基因進(jìn)行基本理化性質(zhì)、內(nèi)含子和外顯子結(jié)構(gòu)、信號(hào)肽、亞細(xì)胞定位和功能位點(diǎn)的預(yù)測(cè)與分析,并構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)。結(jié)果表明:編碼草菇α-淀粉酶的基因有5個(gè),分別為GME2151、GME6695、GME9075、GME10698和GME10705;5個(gè)基因編碼的蛋白相對(duì)分子量介于38.8~64.6kD之間,磷酸化以Ser位點(diǎn)為主,大都存在信號(hào)肽,亞細(xì)胞定位在細(xì)胞外,保守結(jié)構(gòu)域和空間結(jié)構(gòu)相似度較高。和其它的擔(dān)子菌一樣,草菇α-淀粉酶可以分為兩類(lèi):GME9075和GME10698歸為α-淀粉酶Ⅰ類(lèi),GME2151、GME6695和GME10705屬于α-淀粉酶Ⅱ類(lèi)。 更多還原

 

【關(guān)鍵詞】 草菇； α-淀粉酶基因； 生物信息學(xué)； 

【文內(nèi)圖片】

【基金】 草菇育種崗位(編號(hào):CARS 24);黔科合體(編號(hào):Z字2013-4006號(hào))的部分研究?jī)?nèi)容