銀耳一般周期段，大家在中期也應注意病蟲害及雜菌的感染，防治感染傳播面積擴大，下邊我的概述如下：
　　銀耳致病主要有白粉及雜菌感染，一般雜菌有青霉、毛霉、根霉、木霉和各種曲霉，可用75％的酒精注射殺滅 （要用膠布封針口）。白粉病為害極大，發展也較迅速，嚴重時可使整槳無收，一般可用石灰硫磺合劑對室內墻壁、地面噴撒，也可在為害部位擦拭。害蟲一般有食菌螨、線蟲，在夏秋季，特別是出現爛耳時，蠅的為害較為嚴重，爬舔生蛆；使爛耳迅速傳染擴大。防治的方法可用藥物如10％～20％的樂果、敵敵畏、三氯殺螨醇等進行噴撒或熏蒸，但不能直接用于耳朵，以免銀耳留下殘毒。 　　對病蟲害應本著防重于治的方針，按照無菌操作的要求，對培養基、培養室及各種用具徹底消毒滅菌。對周圍環境要保持干凈，消除病蟲源，病蟲害危害嚴重者要徹底隔離淘汰。 　　
　　造成雜菌感染的原因，是由多方面的因素構成的，如季節、環境等。但主要是沒有按照無菌操作的要求去進行。如培養基滅菌不徹底、接種室接種管和所用工具消毒滅菌不良、操作人員的個人衛生欠佳，或者使用了被污染的菌種，都會造成雜菌大量感染，影響栽培產量。
　　現將常見的雜菌分述于后： 　　
　　1、毛霉與根霉：這兩種菌的形態相似，菌絲疏松，生長迅速，毛較長，毛霉的菌絲色白，根霉稍帶土灰色，成熟后都長出灰色孢子囊。這兩種菌都是在多潮和空氣不良環境中發展較快。 　　
　　2、曲霉：分黑曲霉和黃曲霉兩種。菌絲較粗短，孢子都是呈輻射狀生長。黃曲霉色枯黃，黑曲霉色灰黑。培養基濕度小時，蔓延較快。 　　
　　3、青霉：為青綠色菌落，分生的飽子便像掃帚，頂端生有分生孢子，喜低溫，多在潮濕、空氣不良的地方發生。 　　
　　4、鏈孢菌：菌絲呈棉絮狀，生有長串的鏈狀孢子，菌落為鮮艷的橘黃色，培養基濕度大、溫度高時蔓延較快。 　　
　　5、酵母和細菌：屬于單細胞微生物，個體極小，種類繁多，培養基感染此細菌后，表面呈糊狀或粘液狀，使培養料發粘帶臭味，使菌絲死亡。 　　

附：栽培銀耳后的培養基的利用 　　
　　棉籽殼培養基在栽培銀耳過程中被菌絲分解，菌絲充滿于整個培養基，因而還有可利用的豐富養料，具有關資料，可作豬、牛、羊的飼料。我們經喂豬試驗，效果良好，可節約一大部分精飼料。但因使用時間不長，大家可作進一步試驗。其他代用料的培養基，可以漚肥。 　　
　　應注意的問題 ：　　
　　（1）所有制種及栽培過程都應按無菌操作的要求進行。 　　
　　（2）炎熱的夏天或嚴寒的冬天最好不要栽培，如有條件，在夏季要做好降溫工作。
　　方法是：
　　①在周圍環境勤灑水；
　　②從地道或通井的風洞向室內通風；
　　③隔嚴同外界相通的部分，但要不影響光線。冬季主要是保溫工作，方法是可用火墻、火爐、地火、地火道等。也可用火爐加煙筒，這幾種方法明地火道最理想。溫度均勻柔和。火爐的缺點是上下層溫差太大。不論哪種方法，都要求室內無煤煙、無二氧化碳氣體，并且室內各部溫差不要超過2℃。通風時要經過緩沖間，以免冷空氣直接襲入，影響銀耳生長。 　　
　　(3)以采收后曬干的銀耳，不要擠壓防止爛朵。裝入大塑料袋內封口保存。置于通風處，以免霉壞變質。