眼下正是銀耳出耳管理季節，高溫高濕天氣很容易滋生各種銀耳病蟲害，正確防治銀耳病蟲害是決定銀耳產量高低和品質好壞的關鍵因素。因此，正確防治銀耳病蟲害可采用以下方法：
一、對綠霉，鏈孢霉，黃曲霉等競爭性雜菌主要以預防為主，加強堂內通風換氣，控溫控濕。綠霉已侵入木質部，要用刀刮削，再涂上生石灰水或5%的硫酸銅溶液可起到好的效果；有鏈雹霉感染的部位，用酒精或柴油涂抹患處，且立即用火燒發病孔處，防止其漫延。
二、當發現耳棒有酸味，長有瓦灰霉時，應將其選出隔離，較重的用火燒掉，防止傳染。
三、通過控制噴水量和堂內高溫來控制高溫高濕爛耳。
細菌性爛耳用刀將爛耳刮去，爛根剜出，用干凈布擦去粘液，再一粒四環素片兌水一斤或使用濃度為1:500-600倍農用鏈霉素液噴灑。
四、如有白粉病出現，要用刀將耳根剜去，涂以濃度為0.5%的石碳酸溶液（苯酚），如果整根耳棒感染，要將病棒扔出耳堂燒掉，以免傳染。
五、用1:2000倍液濃度菇蟲凈噴霧耳棒及耳堂對菇蚊、菌蛆、線蟲、跳蟲，有殺滅作用；將苦參、苦葛、山野棉皮根的浸出液水兌成1:5倍濃度，噴霧耳堂及耳棒，對螨蟲、菌蛆殺滅效果也較好；用1.8%阿維菌素2000-3000倍液濃度噴霧耳堂及耳棒，對螨蟲、防治效果良好；用1%的生石灰或0.5%的食鹽水噴霧耳堂內外及墻壁，但不能向耳棒噴霧，對蛞喻殺滅和預防效果好。
