有機食用菌的栽培出現病蟲害則就無法拯救了，所以提前預防食用菌病蟲害的發生也就成了一大要點，以下四點是有機食用菌病害的最佳防治方法。
切斷病蟲害傳播途徑。食用菌栽培中病蟲害的來源途徑有三條：一是菌種帶蟲，帶病源;二是培養料和覆土帶蟲、帶病源;三是菇房(棚)內外自然傳播。切斷這三條傳播渠道是病蟲害綜合防治的重中之重。
環境控制，減少病蟲害發生。1.降低料溫：如雙孢菇發菌料溫控制在21℃以下，可有效防治胡桃肉狀菌;金針菇發菌溫度控制在20℃以下;平菇菌袋在20℃以下可以防止菌袋污染。2.加強通風換氣。通風換氣是最好的空氣消毒方式，切勿造成悶濕的出菇環境，不通風有百害而無一利。3.光線調節。不同品種有不同的光照度要求。如雙孢菇應偏暗一些，而白靈菇則需要強一些。
農藝防治措施。不同的土壤有不同的微生物區系，不同的生態環境有不同的生物群落。實踐表明，土棚栽培一般頭年好，二年差，原因就是土棚的生態環境越來越差，也就是說病菌多了、蟲害多了、空氣質量也不好了。為此，必須改善生態條件，優化出菇環境，減少和降低病蟲害的發生。
針對食用菌的栽培特點，食用菌病蟲害的綜合防治是一種好的方法。
冬季想要確保甜櫻桃高產無憂預防晚霜就成了一個關鍵。由于甜櫻桃萌芽、開花較其他果樹早，尤其是近幾年春季氣溫回升快且高，使甜櫻桃開花期更加提前，這樣，晚霜對甜櫻桃花期和幼果就構成了嚴重威脅。因此，預防晚霜是確保甜櫻桃豐產、穩產的一項重要措施。
（1）根據甜櫻桃對環境條件的要求，在規劃建園時，應選擇不易發生霜凍的地塊建園。同時，對晚霜容易發生地區，要發展甜櫻桃可選用萌芽、開花較晚、抗霜凍能力較強的優品種。
（2）加強果園肥水管理，特別是秋季早施基肥，防治早期落葉病，保護葉片，從而增強樹體貯備營養，提高抗凍能力。
（3）在萌芽至開花前園內灌水，降低地溫，可延遲開花3—5天。樹冠噴灑可大枝，涂抹10﹪石灰水，使之反射陽光、降低溫度可延遲開花2—3天。
