1、菌種選用不當：秋季栽培香菇宜選用中溫或低溫型、早熟性品種，而春季栽培應選擇中溫或低溫型、遲熟性品種。若秋栽選用的是遲熟性品種，接種后須經3～4個月，菌絲才能達到生理成熟，當年秋冬季不會出菇，要到翌年春季才能出菇。同樣若春季栽培選用的是中溫型、早熟性品種，接種后60～70天發菌，到出菇時，氣溫升高，不適于子實體形成，就不能出菇。若菌筒完好，可保存越夏，待秋涼后能正常出菇。防治方法：根據當地氣候條件和栽培季節選用適宜的品種。

2、菌絲發育不成熟：菌絲接種到培養基上，當發育到生理成熟時才能形成子實體。菌齡的長短受種性制約和環境條件影響，且溫度是影響菌絲生理成熟的關鍵。中、低溫型的菌類，菌絲生長的適宜溫度為20～27℃，若菌絲長期處在20℃以下，尤其在10℃以下，雖然菌絲培養很長時間，但所需的積溫不夠，菌絲發育不成熟，也就不會出菇。防治方法：將菌袋置于20～25℃條件下繼續培養，或把菌筒堆積起來，覆蓋薄膜提高堆溫，促使菌絲發育。

3、播種期不適宜：不論栽培何種菇，都要選擇最佳播種期，一般菇類的播種期為春秋季。我省秋季栽培適宜的播種期在8月中旬至10月。播種太早，溫度高易感雜菌;播種太晚，若沒有加溫條件，因溫度低而不可能出菇。春季栽培適宜的播種期在1～3月。若播種太晚，因氣溫已超出子實體形成所需的溫度，也就不會出菇。但可將菌筒置于適宜條件下越夏，待秋季氣溫轉涼時再管理出菇。防治方法：根據當地氣候特點，選擇適宜的播種期。

4、菌種退化和制種不規范：由于菌種傳代次數過多、過頻，或保存不當、保存時間過長，或制作菌種時溫度過高等，都會導致菌種優良性狀逐漸退化。若使用已退化的菌種，菌絲萌發遲，發菌慢，菌絲抗逆性差，最終不出菇或出菇很少。另一個原因是制種不規范，菌種廠為節省時間，降低成本，將原種再擴制成原種，或將栽培種再擴制成栽培種。這樣的菌種在生產上表現出遲遲不出菇。防治方法：生產菌種要嚴格控制傳代次數，一般要控制在4次以內。菌種廠要有生產菌種的基本設施及保存菌種的條件。不允許原種再擴制原種，栽培種再次擴制栽培種。栽培者購買菌種時，要問清品種名稱、特性，并挑選生長整齊健壯的適齡菌種，不用退化菌種和老化菌種。自己生產菌種時，要根據栽培時間，計算好菌種生長時間，以免菌種過久存放。