在危害香菇生長的所有雜菌中，木霉威脅最大。木霉又稱為綠霉菌，廣泛分布于各種植物殘體、土壤和空氣中。木霉靠孢子傳播，常借助氣流、水滴、昆蟲、原料、工具及操作人員的手、衣服等為媒介，侵入培養基內，一旦條件適宜就萌發繁殖為害。木霉適應性強，繁殖速度快，它本身能分泌毒素，抑制香菇菌絲生長；木霉還能生長在生長勢減弱的香菇菌絲體上，使香菇組織細胞溶解死亡。當生產環境不清潔、培養料滅菌不徹底、接種操作不嚴格，且處于高溫高濕條件時，就給木霉侵染造成良機，尤其是多年的菇場和老菇棚，常是木霉猖獗為害的場所。 　　
　　木霉至今沒有理想的根治性藥物。因此，創造適合香菇菌絲生長而不利于木霉繁殖的生態環境，是控制危害的根本措施。一旦發生木霉為害，要立即通風降濕，以抑制木霉菌的擴展，處于發菌階段的培養料感病以后，可采用注射藥液的方法抑制木霉擴張，常用的藥液有5％的石碳酸、2％的甲醛、1：200倍的50％多菌靈、75％甲基托布津、pH值為10的石灰水，此外，往污染處撒白灰面，防治效果也很好。