一、病蟲害的侵染途徑
　　1.自然傳播
　　在食用菌制種和栽培過程中，稍有疏忽病菌孢子就會侵入菌種和培養袋，而害蟲則潛伏在菇房周圍的廢料、雜草和枯枝落葉中，發育產卵繁殖，嚴重危害食用菌生產。
　　2.種子帶菌
　　使用的母種、原種或栽培種，未經嚴格檢查，混有雜菌和蟲害，用菌種來生產，導致全部侵染。
　　二、病害及其防治
　　1.真菌性病害
　　①褐腐病又叫草疣孢霉，是阿魏菇和其它食用菌最為常見的病，只感染子實體，不感染菌絲體，子實體受害后變褐色，菇體畸形、潰爛，有臭味。
　　防治措施：常壓消毒培養袋，滅菌要徹底，覆土用1∶500多菌靈或苯菌靈、敵克多等噴灑處理。
　　②鏈孢霉俗稱紅色面包霉，是污染菌種和菇房的重要病害。霉菌絲初為白色絨毛狀，后逐漸變為桔黃色粉粒狀，最適溫度為23℃。
　　防治措施：搞好接種室、菇房及周圍的環境衛生；制菌種的培養料滅菌要徹底；降低菇房溫度和濕度，加強通風換氣；在料內加入0.1%多菌靈拌種，或加入1%石灰，如發現此霉菌勿用噴霧器噴藥防治，應遠離菇房埋掉。
　　③木霉危害多種食用菌，抑制食用菌的生長，霉菌初為白色棉絮狀，產生孢子后，逐漸變綠色，最后呈墨綠色。
　　防治措施：用1%石灰加0.2%多菌靈拌料。點片發生時，將霉點去掉，用石灰或濃石灰水覆蓋發病部位。菌床上噴灑0.2%多菌靈、克霉靈或代森鋅。
　　2.細菌性病害
　　①細菌斑點病由假單孢菌引起，菌蓋上有小的黃色或蒼褐色區，后變成凹陷斑點，斑點干后菌蓋裂開，形成不對稱子實體，菌蓋上積水易發生斑點病。
　　防治措施：菌蓋表面不積水，防止培養料過濕；菇房濕度保持在85%以下；噴1∶600倍的漂白粉液。
　　②菌褶滴水病由假單孢菌引起，主要侵染菌褶，被感染部位變成奶油色小液滴，最后菌褶爛掉，變成褐色粘液團。
　　防治措施：同細菌斑點病。
　　三、蟲害及其防治
　　1.菌蠅
　　成蟲是很小的蠅子，幼蟲為蛆，白色或米黃色，以幼蟲危害菌絲體和子實體，嚴重時可把菌絲全部咬斷，料變黑發粘，有臭味。
　　防治措施：菌蠅多從菇房外飛入，要搞好環境衛生，菇房門、窗裝紗窗，阻止成蟲飛進；每平方米用除蟲菊1克，加草木灰，撒在地面、墻角和走道間，連撒2～3天，效果較好。在菇袋入棚前，菇棚每立方米空間用1克高錳酸鉀加100毫升甲醛熏蒸，或用硫磺粉（50米大棚用15千克），燃燒熏棚48小時，在熏棚前地面灑石灰粉，后用噴霧器噴灑200毫升的敵敵畏熏蒸后可殺死螨類、菌蠅、菌蚊、跳蟲等害蟲。
　　2.菌蚊
　　個體很小，成蟲似蚊，為黑色，幼蟲為蛆，以幼蟲危害子實體和菌絲體。
　　防治方法：同菌蠅。