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    黑柄炭角菌的單核苷酸多態性研究(英文)


    【發布日期】:2019-01-15  【來源】:菌物學報
    【作者】馬橙 陳作紅 張平
    【機構】湖南師范大學生命科學學院應用真菌研究室
    【摘要】以SNPs作為分子標記,對黑柄炭角菌的生活史和遺傳多樣性進行研究。基于黑柄炭角菌的基因組文庫,在兩個菌株(X-WC和X-LY)的34個片段(19,680bp)中共發現193個SNPs,SNP發生率為0.981%。193個SNPs位點都有兩個可變的核苷酸,其中132個轉換,61個顛換,轉換與顛換比率為2.16。此外,對兩個菌株序列進行比較,發現了41個插入/缺失位點。從34個片段中選擇4個片段,分別比較菌株內的SNPs情況。X-WC的菌株內SNP發生率為每個核苷酸1.308%(30/2293),X-LY的菌株內SNP發生率為每個核苷酸1.352%(31/2293)。序列圖譜中有31個重疊峰,表明菌株X-LY的菌核是異核體。 
    【基金】Supported by the Key Scientific Research Fund of Hunan Provincial Education Department(No.08A044); National Natural Science Foundation of China(No.30770010); the Program for Excellent Talents in Hunan Normal University(No.2008-6);
    【關鍵詞】黑柄炭角菌; 分子標記; 單倍型; 異核體;
     
     
     
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