【作者】 劉芳； 王威； 謝寶貴； 

 

【Author】 LIU Fang;WANG Wei;XIE Baogui;Mycological Research Center of Fujian Agriculture and Forestry University;

 

【機構】 福建農林大學菌物研究中心； 

 

【摘要】 以金針菇(Flammulina velutipes)1123菌株的單孢W23基因組為參考完成其菌絲和原基轉錄組測序與數(shù)據(jù)分析,研究兩樣本間差異基因,并對差異基因進行GO功能和KEGG Pathway顯著性富集分析。結果表明:兩個樣本中共有顯著性差異表達的基因3310個,其中在原基中上調、下調的基因數(shù)分別為1686、1624個,只在原基中表達的基因有26個。GO功能分析結果表明,在原基中膜封閉腔、內膜系統(tǒng)、細胞器腔、核糖核蛋白復合體、翻譯調節(jié)器、發(fā)育過程、免疫系統(tǒng)過程、多細胞生物過程這8個GO基本單元中的差異基因全部呈現(xiàn)上調表達。Pathway功能富集分析結果表明,核糖體與DNA復制中的差異基因全部呈現(xiàn)上調表達,糖酵解途徑中從D-葡萄糖轉化成丙酮酸過程相關的11個差異基因全部呈下調表達,磷酸戊糖途徑中相關的13個差異基因中有11個基因呈下調表達。 更多還原

 

【關鍵詞】 原基； 差異基因表達； GO功能； Pathway分析； 

【文內圖片】

【基金】 國家現(xiàn)代農業(yè)產業(yè)技術體系建設專項資金(編號:CARS24);973計劃項目(編號:2014CB138302)基金資助