（1）細菌多數發生在母種斜面上，原種、栽培種危害都比較輕。細菌污染的特點是繁殖快，一般接種后10～24小時就能表現出來。防治方法：一是接種工具一定要酒精擦和用火焰滅菌。二是培養基滅菌要按照規定進行。
（2）青霉和木霉青霉菌危害常見于原種和栽培種。侵入后很快萌發長成菌絲，覆蓋在培養基表面。木霉菌發生在子實體形成期。這兩種雜菌出現時，應及時把它挖除。
（3）鏈孢霉在夏季高溫季節，最容易發生鏈孢霉，并產生大量橘紅色粉狀孢子。為鏈孢霉污染的菌種，要及時淘汰；瓶子要徹底清洗，并用0.05％高錳酸鉀水浸泡，或經蒸煮滅菌后方可使用。
