黑頭病又叫細菌性褐斑病，是一種假單孢桿菌，屬于裂殖菌門、裂殖菌綱。病菌呈桿狀，形成白色菌落，革蘭氏染色呈陰性反應。　　
　　一、發生條件　　
　　該病害發病的內因是品種的不抗病性，外因是高溫、高濕或噴灑不干凈的水把細菌帶到子實體上，如菌蓋表面長時間有水滴或濕度過大極有利于該病害的發生，通風不暢能加劇病害的發展，中溫條件適合發病。　　
　　二、防治措施　　
　　1.保持菇場清潔衛生，及時清除病菇和廢料；菇房、床架、用具等用前要用1：50倍的金星消毒液或2%的漂白粉等徹底消毒，尤其是原發病害較重的菇棚。　　　
　　2.拌料時應將疣霉凈按1：1000倍比例兌水拌料，不可用高毒、高殘留的防污劑之類，以確保生產效果。　　
　　3.金針菇栽培時培養料應徹底滅菌，蘑菇和平菇栽培時培養料應充分發酵，腐熟均勻，覆土材料用甲醛熏蒸消毒即可。　　
　　4.金針菇出菇期控制出菇室溫度在15℃以下，避開高溫、高濕季節出菇，高溫時加強通風散熱，平菇出菇期溫度不要超過18℃，如果氣溫突然升高，要采取降溫措施，如開窗、揭膜、遮陰等，但要注意菇房內溫度波動不能過大，防止水汽凝結，產生水膜。　　
　　5.發現病菇要及時摘除，并立即加大通風量，暫停或減少噴水，迅速降低溫度，并用藥控制病害，如可向料面噴灑5%的石灰水清液，也可噴灑每毫升100~200單位的鏈霉素液或300單位的土霉素，或500~1000倍的漂白粉液，每2天1次，施藥前后菇床停水1天，間隔3~4天再次用藥，連續用3次以上，能有效控制病害蔓延。發病嚴重時，應先清除病菇，清理料面或覆土后再按上述方法噴藥。