在食用菌的栽培過程中，蟲害是不可忽視的重要環節，一旦大量發生，輕則減產，重則絕收。食用菌蟲害和其它作物的蟲害的發生不太一樣。一方面食用菌子實體對藥物非常敏感，在出菇期一般不能直接使用農藥；另一方面，食用菌栽培期出現的蟲害都在菌袋內部，害蟲咬食菌絲，甚至把菌絲吃光，發展極其迅速，而且噴藥很難防治。因此食用菌蟲害的防治不能簡單地用防治農作物蟲害的方法來防治。應該從以下幾方面去加以預防，把病蟲害消滅在萌芽狀態。
　　第一步，對舊菇棚和舊場地要嚴格處理；舊菇棚最好每年拆掉爆曬個3個月以上，或和其它作物輪作。舊菇棚沒拆掉時，在使用前一定要對大棚進行徹底消毒以防蟲害的發生。采用"菌滅絕敵菇蟲"對大棚的上下和空間進行多次噴霧，效果十分明顯。噴霧一次不可能很勻，蟲害一遍不可能都打死，所以要做到噴藥的連續性，才能達到最佳的效果，一般應連續噴灑四遍以上。
　　第二步，培養料中要加入一定量的殺蟲劑，防止料內生蟲；首先，熟料栽培是防治食用菌害蟲的最有效的方法。但是大多數栽培戶由于條件的限制多采用生料或發酵料栽培。病蟲害的預防應從培養料拌料開始。栽培時培養料中應加入一定量的無公害食用菌殺蟲殺菌劑。具體的方法為：公斤培養料可加入毫升菇耳菌蛆靈、阿維菌素等。不能在拌料時加入，應該在裝袋前噴入料內，才能起到很好的作用。
　　第三步，菌袋進入大棚后，在發菌期要對菌袋進行精細管理，防治害蟲進入菌袋；大多數栽培者認為只要裝好大袋就不用管理了，往往就在這個時候因為農忙，一時疏忽菌絲被蟲危害了，造成后期大量減產。正確的方法應該用以下幾種結合進行，才能起到最好的預防和防治效果。
　　用"阿維菌素"噴灑菌袋的通氣孔，起到封閉的作用，一次噴藥，三個月有效
　　倍液、每隔一周噴灑一次菌袋和空間，以防菌袋生蟲，使菌絲能健壯的生長。
　　培養料中還要適當的加入菇大壯、胖大壯、菇多生、平菇轉潮王等食用菌專用營養素，可使菌絲生長強壯，加快菌絲的生長速度，從而抑制病蟲的發生。
　　第四步，加大菌種的用量也是預防蟲害的一種有方法；
栽培食用菌的過程中，加大菌種的用量可以使菌絲生長快而且健壯，蟲害很難進入袋內。所以栽培時菌種量要適當大一些（至少），才能保證菌袋生長迅速而不被蟲危害。
　　第五步，蟲害發生后要及時進行防治； 發現生長期蟲害發生時，要對菌袋進行熏蒸處理，使藥物進入菌袋內部殺死害蟲。用阿維菌素進行熏蒸，熏蒸時應對有蟲的菌袋進行覆蓋，以防氣體外溢，影響殺蟲的效果。
　　在出菇期發生蟲害時，每100平方米菌床用多菌靈1000倍液10千克進行噴霧防治或阿維菌素直接噴灑菌袋的表面和大棚的空間，每天一次，并且連續噴遍以上，可使害蟲得到有效的控制。總之，食用菌的害蟲重在預防，綜合防治就可徹底解決。