蘑菇黃菇病主要是因為低溫季節管理不當，在低溫季節菇棚內濕度有可能過大，噴水過度，菇體上附著游離水過多，吸水后不能蒸發，致使菇體新陳代謝減弱，造成各種病原菌乘虛而入，大量繁殖，而引發子實體的各種病害；持續低溫天氣，造成菇棚內溫度過低，食用菌子實體長期處于不良的生活環境而導致發病；有的食用菌品種出菇期處于3~4茬，菌袋內營養不良，現蕾后的子實體得不到充分的營養供應，而造成發黃死亡。
防治措施：
一是出菇棚要經常噴灑各類殺菌劑，如菌絕殺、細菌殺、蘑菇祛病王、克霉靈等，一般可每周噴灑1次；
二是菇棚溫度過低時，噴水不能過多，濕度以能保證子實體正常生長為宜；
三是盡量提高菇棚溫度，如平菇栽培，白天棚溫以在15℃以上為宜；
四是正確了解各類品種的溫型及正常生長溫度，在管理上做到有的放矢，正確管理；
五是應經常往菇體上噴灑各類抗病增產劑，可選擇菇豐一號、光大菌王、立信菌王、三維營養精、菇衛士、菇多生等；
六是一旦發病，可噴灑細菌殺、菌絕殺、蘑菇祛病王、菇衛士、光大菌王、立信菌王等綜合防治。
