研究人員從普渡大學（Purdue University）和英國皇家植物園（the Royal Botanic Gardens）搜集真菌，然后從中提取遺傳物質，幫助了一組研究人員繪制出了蘑菇的生命之樹圖譜，這幅圖譜展現(xiàn)了幾種重要的蘑菇種類之間的關系，拼湊出了它們完整的進化歷史，這正是科學家們在過去的200多年里一直奮力研究的難題。
研究小組使用了冷凍、加熱干燥、冷凍干燥的方法處理了標本，然后從中提取DNA來分析39個基因組的數(shù)據(jù)，這39個基因組代表了大部分常見的傘菌目（ah-gehr-ah-KAY-leez），它們囊括了我們最熟悉的一些蘑菇綱目，其中包括可培植食用蘑菇、致幻蘑菇和致命蘑菇。高通量測序技術幫助科學家確定了七個新亞目和傘菌目的主干，為驗證蘑菇的進化假說提供了框架。
真菌學副教授Catherine Aime說：真菌學真的是生物學中最新的研究領域之一，我們知道真菌的種類是植物的6到20倍以上，但我們對真菌的了解卻很少。從林奈（Carl von Linn，18世紀瑞典著名博物學家）開始人們就一直試圖弄清楚各種蘑菇之間的關系。現(xiàn)在終于這個謎團終于被解開，這著實是一件讓人興奮的事。
真菌對于生態(tài)系統(tǒng)、植物和動物的健康必不可少。它們可以使倒木等有機物腐壞，分解物質并釋放養(yǎng)分供給其他生物體。大多數(shù)陸生植物依靠有益真菌來傳輸水分和其他營養(yǎng)，并且牛等反芻動物的腸道真菌在消化過程中起到了至關重要的作用。大多數(shù)人體中也寄存著真菌，這有助于維護我們的自然植物群的平衡。
盡管真菌如此重要且種類豐富，然而我們卻對真菌所知甚少。Aime說，許多真菌物種都有著神秘莫測的生活史，因此給研究帶來了不小的困難。絕大多數(shù)真菌都很微小，只有少數(shù)綱目的蘑菇是肉眼可見的。有些真菌生命周期復雜，與其他多細胞有機體無法類比。還有一些真菌極為罕見，關于它們的記錄很少，有些用常規(guī)方法根本檢測不到。
Aime說，真菌的神秘正是現(xiàn)在保存的真菌標本（fungaria）如此寶貴的原因之一。這些標本為已知真菌的多樣性提供了全景圖，常常是稀有物種唯一可研究的領域。
她還說道：要想到大自然中重新搜集其中的很多標本，即便不花上有生之年，也將耗費數(shù)十年光景。
以前，由于基因組測序技術非常復雜，以及從年久、干燥的標本中獲取DNA的質量較差，因此真菌標本在基因研究中發(fā)揮的作用有限。這一狀況在最近幾年才得以改善。隨著科技的進步，Aime和她的同事們得以使用從普渡大學和英國皇家植物園采集而來的真菌標本中提取出的短DNA序列，組成完整的基因組，并且找到了充當鏈接相近蘑菇種類的標記基因，最終完成了生命之樹圖譜。
這一圖譜提供了迄今最清晰、最詳細的闡述，說明了蘑菇之間的基本關系以及某些蘑菇是在何時進化產生的。Aime說，根據(jù)生命之樹的描繪，最早的傘菌目是分解物或活體寄生物，其類別包括病原體，它們從其他有機體中獲得所需營養(yǎng)。
Aime 說：我們產生了這樣的觀點，那就是生物體隨著進化會變得更自私，它們在演變成病原體的過程中學會了如何利用生存系統(tǒng)。但這種自私癥狀可能僅僅出現(xiàn)在早期，隨著時間的推移，一些物種會共同進化，最后變得更加能夠互惠共生。
Aime還說，這項研究還強調了真菌標本作為基因時代的科研資源的重要性。
她還說道：我們可能正處在一個重要的收藏品革命的前夜，人們認為真菌標本類似于郵票藏品，但實際并不是這樣的。這些標本是我們得出所有生物學觀點的依據(jù)，對于一些瀕危或可能已經滅絕的物種來說，它們更像是我們唯一的資源庫。我們收集和保存盡可能多的物種是格外重要的。未來的技術可能讓我們有辦法使用這些保存的標本，其方式是我們現(xiàn)在無法想象的。我們必須在物種消失前將它們保存起來。
