一、 發生爛棒的原因分析：
2、季節安排不當： 一是春栽黑木耳接種期安排過遲或秋栽黑木耳接種期安排過早，造成養菌期間超溫，菌絲體內細胞質營養液流出，受到環境因素的影響，表現吐黃水現象。出現吐黃水的栽培袋，袋內其它菌絲被粘液包圍，生理活動受到限制，菌絲逐漸死亡，高溫高濕條件下各種雜菌趁機感染。 二是秋栽黑木耳栽培季節安排過遲或春栽黑木耳接種期安排過早，發菌期間氣溫低于20℃，菌絲生理活性低，發菌緩慢，不能迅速地占領培養料，引起雜菌感染，導致菌棒腐爛。
3、養菌期間管理不當：發菌前期黑木耳菌棒所處的室溫較低，引起個別接種穴菌絲死亡，感染雜菌；發菌后期，氣溫漸漸升高，加上菌絲體呼吸作用放出熱量，當氣溫超過25℃時，沒有及時采取通風降溫措施，發生燒堆悶菌現象；另外發菌期間通風不良，不能有效地排出培養室內的CO和其它有毒氣體，使菌絲活動受阻，活力下降，引起雜菌感染。
4、耳棚未清理干凈或靠近污染源：生產中使用舊耳棚，在采耳過程中培養基、子實體及已受感染的塑料袋及其它污染物未清理干凈，耳棚未經過消毒，成了雜菌繁殖的培養基；有的耳棚直接靠近污染源或使用了被污染的水，直接產生雜菌，引起菌棒腐爛，造成經濟損失。
5、出耳期間水分管理不當：在木耳原基形成期，澆水過早，木耳原基未封住劃口，水流進或滲入劃口內，造成感染。木耳原基分化期，剛形成的子實體原基處于芽孢狀態，芽孢因吸水過多而發生細胞破裂，劃口處菌絲停止生長而退菌，形成的子實體原基失去菌絲營養供應而停止生長，造成霉菌感染或流耳。
6、耳棚內通風不良：耳棚選址不當，或棚頂、棚周覆蓋物太厚或通風不及時等原因，使耳棚內缺氧，CO和其它有毒氣體積聚，木耳菌絲生活力下降，子實體生長緩慢或停止生長，為雜菌繁殖生長提供條件，發生爛耳或流耳現象。
7、采耳過晚：黑木耳子實體營養豐富且又是膠質狀，采收不及時，子實體老化變薄，失去彈性，不但質量差，而且極易產生霉菌，造成流耳、爛耳現象。
