2、選用抗病強品種：不同品種在同一菇棚內的抗病能力有相當的差異，從南方引進的平菇高產品種，不一定適合北方的條件，抗逆力性差就會導致發病，應選用適合當地條件的優良品種，有條件的對平菇菌種進行脫毒處理，提高其抗病能力，更有利于高產穩產。
3、藥物防治：
細菌性病害發展迅速，最快2-3天，慢則也只有5-7天，在幼菇生長期一旦發生細菌性病害應及時用藥物防治。常用藥物為：
（1）黃斑消：屬廣譜強力殺菌劑，1：500倍2-3天一次，連噴2-5次。
（2）潔霉凈：將10g藥片，兌水25~35市斤，噴灑病菇3-6次。
（3）黃菇一噴靈：在使用黃斑消藥物防治無效的情況下，使用黃菇一噴靈效果較佳。出菇期每3-7天對菇棚內地毯式噴灑一次以預防外來病菌的侵染。出現病害時，直噴菇體或料面，一般病情噴灑1-2遍即愈，病情嚴重時連噴2-3遍即愈，用藥不妨害子實體生長。噴藥后注意加強通風。
