6.抗生素  母種培養基加入適量抗生素如鏈霉素、慶大霉素、金霉素等可抑制細菌的生長，加入量一般以每毫升含100～200單位為宜。銀耳發現受紅酵母為害時，應及時刮除有病的子實體，并噴灑每毫升100～200單位鏈霉素。
　　7.過磷酸鈣  有些病原菌如白色石膏霉。褐色石膏霉等喜高溫、偏堿條件，堆料時可適當增加過磷酸鈣和石含量，既可提供營養又有防病作用，在菇床上局部發生這些病菌時，也可將過磷酸鈣直接撒在發病的料上，能抑制病菌的蔓延。
　　8.波爾多液   一般用磷酸銅1公斤、生石灰1公斤和水100公斤配制而成，隨配隨用。蘑菇貝勒貝孢霉病的病原菌對銅制劑很敏感，用波爾多液或硫酸銅稀釋液直接噴灑發病部位，對控制病害的擴大有一定作用。
　　9.敵百蟲   草菇折翅菌蚊、平菇厲眼蕈蚊等發生嚴重時，可在出菇前或采菇后用90％敵百蟲1000倍液噴灑。
　　10.敵敵畏   菇、耳房周圍定期噴灑50％敵敵畏1：1000倍液、可有效消滅蟲源。
　　11.溴氰菊酯   平菇厲眼蕈蚊發生嚴重時，可于采菇后用2.5％溴氰菊酯1500～2000倍液噴灑。
　　12.毒餌誘殺   黑腹果蠅等成蟲喜在爛果或發酵物上取食和產卵，可取一些爛果和酒渣放在盤中，倒入少量50％敵敵畏1000倍液以誘殺成蟲。廝腐蠅成蟲對醋酒液有趨性，可用酒：糖：醋：水=1：2：3：4的糖醋酒液加上幾滴敵敵畏液，置于燈光下誘殺成蟲。用砷酸鈣于餅糠（1：10）制成的毒餌，于傍晚撒于栽培產生附近，可誘殺蛞蝓、蝸牛。