一、品種選用不當。春季栽培香菇，早春制袋，秋、冬、春季出菇，應選擇中溫或低溫型，遲熟性品種，如939、渭香一號等。反季節栽培香菇，晚冬或早春制袋，晚春、夏、秋季出菇，宜選用中溫或高溫型，早熟性品種，如申香10號、申香6號、931、武香1號等。若反季節栽培選用的是遲熟性品種，接種后須經3-4個月，菌絲才能達到生理成熟，若菌筒完好，可安全越夏，當年晚春和夏季不會出菇，要到秋冬和翌年春季才能出菇。同樣若春季栽培選用的是中高溫型、早熟性品種，接種后60-70天發菌，到出菇時，氣溫升高，應按照反季節栽培技術進行出菇管理，深冬及早春季節菌棒養分幾乎耗盡，產量銳減，無生產意義。防治方法：根據當地氣候條件和栽培季節選用適宜的品種和相應的栽培技術。
　　二、菌絲營養不足。⑴木屑不合格。選用的果樹枝條等闊葉林木屑腐朽變質，致使供應香菇正常生長發育的有效營養不足甚至枯竭。選用的松、杉、樟、柏等針葉樹木屑未經處理直接使用，所含烯萜類物質能抑制甚至殺死香菇菌絲，造成菌絲營養不足，出菇受挫。預防方法：選擇果樹、柞樹、樺木等薔薇科、殼斗科、樺木科的闊葉樹木屑較為理想，這類樹的木屑新鮮，干燥、無蟲害、無霉變。⑵管理不合理。主要表現在制袋養菌、越夏和間歇養菌三個時間段。預防方法：通過刺孔、加溫，疏堆，通風、遮陽等措施控制養菌，越夏的菌棒環境溫度為18-25℃。一茬菇出菇結束后，間歇養菌時間一般在7-15天，甚至更長，以使菌絲復壯，積累更多營養，下茬菇刺激出菇時間以上茬菇菇腳菌絲轉色最佳。
　　三、轉色管理不當：有的菌棒因受光較強，空氣過于干燥或翻動次數過多等的影響，往往轉色過深，形成較厚的甲狀菌皮，導致出菇困難。預防方法：轉色期間，菇棚溫度保持18-22℃，相對濕度55-75%，且維持散射光照。菌皮過厚的菌棒出菇時應通過菌棒浸水后蓋膜提溫方式軟化菌皮，再刺激出菇。
　　四、菌絲發育不熟：菌絲接種到培養基上后，當發育到生理成熟時才能形成子實體。菌齡的長短受種性制約和環境條件影響，且溫度是影響菌絲生理成熟的關鍵。中、低溫型品種，菌絲生長的適宜溫度為20-25℃，若菌絲長期處在20℃以下，尤其在10℃以下，雖然菌絲培養很長時間，但所需的積溫不夠，菌絲發育不成熟，也就不會出菇。防治方法：將菌袋置于20-25℃條件下繼續培養，或把菌筒堆積起來，覆蓋薄膜提高堆溫，促使菌絲發育。
　　五、菇棚溫度過低：冬季或者早春菇棚溫度低于8℃就會造成不出菇，這是香菇的生理特性決定的。預防方法：通過煙道、火爐、暖氣、菇棚曬膜等方式提溫，使菇棚溫度達到8-25℃。
　　六、菌種質量不高：防治方法：生產菌種要做好出菇試驗示范，嚴格控制傳代次數，一般要控制在3次以內。菌種場要有生產菌種的基本設施及保存菌種的條件。杜絕原種再擴制原種，栽培種再次擴制栽培種。栽培者購買菌種時，要在技術部門指導下，到信譽良好、技術力量雄厚的科研單位購買，問清品種名稱，特性，并挑選生長整齊健壯的適齡菌種，不用退化菌種和老化菌種。