在靈芝栽培中，常因雜菌的污染造成不同程度的損失，其中綠色木霉是發生頻率和危害程度最高的，在靈芝栽培的各個階段均可發生。綠色木霉廣泛存在于自然界的各種有機物質和土壤中，還常以分生孢子的形式漂浮在空氣中，它適應性強，特別是在營養豐富的基質上生長迅速，傳播蔓延快，既可以和栽培的靈芝菌絲競爭養料，消耗養分，也可以分泌毒素破壞靈芝菌絲的細胞質，抑制靈芝菌絲的生長。在栽培中，如果采取了以預防為主并輔助治療的措施，可取得較好的效果。
　　一、選用抗雜性好、菌絲生長勢強的靈芝品種。
　　二、嚴格挑選栽培用種：所選菌種要求種性純正，菌絲生活力強，菌絲潔白、濃密、健壯、菌齡適宜。
　　三、搞好栽培環境的清潔衛生：要清除菇房內的菌渣、垃圾，徹底清洗栽培用架，并進行空間消毒，消滅雜菌隱匿場所，以減少傳播媒介。搞好環境衛生對防止污染能起到事半功倍的效果。
　　四、嚴格選料：培養料要求新鮮、無霉變，用前要暴曬數天，培養料配方要合理，主料和輔料要充分拌勻，含水量控制在60%～70%，裝量合適，松緊適度，裝好后立即進行高壓或常壓滅菌，以防培養基酸化。滅菌要徹底。
　　五、接種時力保無雜菌污染：接種時操作人員的雙手、衣物和所用接種工具、材料須嚴格消毒，接種動作要盡量快捷、熟練，防止接種過程中帶入雜菌。對滅菌過程中破損的袋子要用膠布封好，并在封口處用75%酒精消毒。
　　六、加大接種量：適當加大接種量，可使靈芝菌絲以絕對優勢迅速占領地盤，減少雜菌的污染，起到以菇抑菌的作用。
　　七、保證培養室內具有適宜的小氣候，把好菌絲培養關：保持25℃左右的溫度、60%—70%的濕度，注意通風換氣，嚴防高溫高濕，創造靈芝菌絲生長的最適宜環境條件，促進靈芝菌絲快速生長迅速占領整個料面。
　　八、抓好出芝階段的管理：靈芝原基長出后，要及時拔去棉塞或開袋，以免原基損壞而感染綠色木霉菌。做好保溫保濕工作，同時加強通風，并給予一定的光照，促使原基健康地長成子實體，子實體成熟后及時采摘。
　　九、加強早期防治：菌絲體生長階段若發現料面有綠色木霉污染，可用石灰水擦洗患處，或用石灰漿封殺，或注射5%石灰酸液等；如子實體感染綠色木霉，應及時摘除，以防蔓延。用多菌靈和豐收純的400～1500倍液拌料，對綠色木霉的抑制效果很好，但同樣也抑制靈芝菌絲的生長。而用0.35克/升的氫氧化銅拌料，既能有效地抑制綠色木霉的生長，同時對靈芝菌絲的生長基本無影響。