(一)木霉、青霉、曲霉、鏈孢霉等的發生與防治
　　1．幾種霉菌的形態特征與生活習性。
　　2．菌床受害情況。
　　(1) 在通氣差、濕度大的情況下，出現白色、黃色、紅色等
　　(2)能重復多次侵染畦床；
　　(3)危害畦床時，受害部位呈腐爛狀態，菌絲消失，不出芝。
　　2．防治措施：
　　(1)畦床水分適當，床面不能積水；
　　(2)受害部位用0.2％-0.5％的過氧乙酸涂抹或用石灰粉覆蓋；
　　(3)受害嚴重的應將腐爛部位挖除，再用石灰粉覆蓋，以防止生毛霉再復發。
　　(二)菌絲徒長畦床菌絲長到一定階段后應由濃密氣生狀態轉入倒伏結菌階段，若菌絲繼續生長而遲遲不倒伏，長時間不出芝，此現象稱菌絲徒長。
　　1．徒長的原因
　　(1)沒有及時通風或透氣時間不夠，畦床處于缺氧狀態．菌絲生理活動發生紊亂而徒長；
　　(2)畦床所處環境相對濕度太大，氣生菌絲不倒伏；
　　(3)菌絲沒有發育成熟，過早進行覆土，使菌絲在畦床上繼續旺盛徒長；
　　(4)培養料中含氮比例過高，易造成菌絲徒長。
　　2．徒長的防治措施
　　(1)培養料栽培配方中含氮量適當，常用的麥麩或米糠一般不超過20％，以免菌絲徒長；
　　(2)菌絲體培養成熟后再進行覆土出芝；
　　(3)注意通風透氣，降低畦床水分濕度，控制菌絲徒長；
　　(4)可用1％-3％的石灰水噴灑畦床，待表面稍干后再覆蓋樹枝等遮蓋物，也可防止菌絲徒長。
　　(三)菌絲萎縮菌棒覆土后遲遲不萌發或萌發后生長不良，慢慢萎縮，或頭批芝產出后出現菌絲萎縮，影響產量。
　　1．萎縮原因：
　　(1)畦床覆蓋物太薄，進床后溫度過高，發生燒菌，導致菌絲萎縮；
　　(2)培養料水分過高，引起菌絲自溶；
　　(3)噴灑多菌靈或其他藥液不當，抑殺菌絲而導致萎縮；
　　(4)菌種質量太差，抗逆性差，經不起不良環境的刺激；
　　(5)畦床環境缺氧，菌絲生理活動受阻導致萎縮。
　　2．防治措施：
　　(1)選用優質菌種；
　　(2)因水分、溫度等條件引起的菌絲萎縮，可重新覆埋菌棒進行補救；
　　(3)注意畦床水分、溫度的調節，注意通風換氣；
　　(4)注意噴施藥液，以免對菌絲產生不良影響。