香菇在栽培過程，常會發生病蟲害，應該采取以防為主，防治結合的措施才能收到好的效果。
　　一、常見病害：
　　1．木霉；菌絲生長迅速，在25攝氏度經2～3天菌落便長成綠色分生孢子。可危害香菇菌絲體和子實體。
　　2．鏈孢霉：在25攝氏度時生長極快，2～3天可形成橙紅色分生孢子。木屑袋栽香菇多受此菌為害，能抑制香菇菌絲生長。
　　3．青霉：此菌在20～25攝氏度、空氣相對濕度在80～90%時最適生長。成熟的菌落成蘭綠色。能破壞香菇菌絲生長、影響子實體形成。
　　4．曲霉：菌落為黃綠色或黑色。在25～30攝氏度，空氣相對濕度85%時大量發生。此菌主要危害香菇的菌絲體，致萎縮死亡并發出臭氣。
　　5．毛霉：菌絲淺黃褐色、蓬松發達，孢子囊褐色，多在16～23攝氏度，空氣相對濕度85%時發生。此菌能抑制香菇菌絲生長，消耗培養料養分。
　　6．根霉：菌絲白色、蓬松發達、孢子囊黑色，生長適溫為28～30攝氏度、空氣相對濕度95～100%。此菌能抑制香菇菌絲生長，有時也侵害子實體，消耗培養料養分。
　　7．細菌：熒光假單孢桿菌引起子實體產生褐色斑、腐爛、發臭、產生粘稠物。此病多在20攝氏度、高溫的環境發生。
　　樺褶孔菌、云芝菌、粗毛硬革菌、裂裥菌、膏藥菌等能引起菇木木腐。
　　二、常見蟲害：
　　螨類：吃食香菇菌絲。
　　線蟲：寄生或腐生于香菇菌絲內或培養料中，造成危害。
　　跳蟲：咬食香菇菌絲和子實體，使小菇枯萎致死。
　　白蟻：咬食香菇段木或子實體，造成危害。
　　病蟲害的防治：
　　工作人員要對培養料、使用器具、菇床做好清潔、消毒處理。
　　合理調節菇房或菇場的濕度，加強通風換氣、保持菇房或菇場空氣清新。
　　及時發現病原、小量時立即挖除，并用石灰水涂抹患處。
　　蟲害防治主要做好菇房或菇場消毒處理。可用20%三氯殺螨醇800倍液，或5%福爾馬林液等藥物噴灑菇房或菇場。