平菇出菇階段，易被有害細菌侵染，故而常發生軟腐病、斑點病等細菌性病害。一些采收過頭茬平菇的菌袋兩頭出現了暗褐色水爛，導致二茬菇出菇困難。該種情況是由于細菌感染引起的軟腐病。

平菇軟腐病發生時，菌絲退化，料袋表面色澤發暗、變軟、水爛，伴有臭味。發病原因： 

1、平菇采收后，在料袋表面形成傷口較多，為有害細菌侵染料袋創造了“通道”，又加之部分菇農為了促進下茬菇來潮，而加大了噴水，造成料袋兩頭濕度過大，或有水滴，也利于細菌性病害發生。 

2、近段時間，受到連陰雨天影響，棚內相對濕度過大，通風不良，棚溫過低，從而誘發了該病的發生。 

3、有些菇農在料袋進棚前，未對棚室進行殺菌消毒處理，從而有害細菌在遇到適宜環境條件下，侵害了菌袋。 

建議菇農綜合預防該病發生： 

1、注意菌袋進棚前，對菇棚進行殺菌消毒處理，降低棚內的有害菌數量。可用生石灰進行地面處理，100斤/畝。也可通過藥劑熏蒸的方法，如用百速煙劑，500克/畝，閉棚熏蒸時間在8—10小時。 

2、調控棚內環境。采取夜間放風的措施，加大通風量，滿足平菇出菇需要。白天為菇棚創造散射光的環境即可，菇棚棚面可采用放“花簾”措施。 

3、藥劑防治：可噴施農用鏈霉素5毫升＋50毫升綠風95＋綠芬威1號17克，既能防治細菌病害發生，又能促進下茬菇來潮，5天1次，連噴2次。