蘑菇對環境的反應較為敏感，不良的栽培環境，會使其正常的生長發育受阻，產生各種異常現象，導致蘑菇減產、質量降低。蘑菇常見的生理性病害有菌絲徒長、硬開傘、薄皮早開傘或出現地蕾菇、空根白心菇等。現介紹如下：  菌絲徒長 癥狀：菇床覆*調水以后，蘑菇絨毛菌絲會持續不斷地往細*表面生長，嚴重時會形成一種細密的、不透水的菌被，從而推遲出菇時間，降低蘑菇的產量。 
      發生原因：多是由于*層調水較輕、較快，菇房溫度超過22攝氏度、濕度超過90％、通風不良所造成。 
      預防措施： 
      1、盡量不用氣生菌絲生長過于旺盛、過于濃密的菌種。 2、覆*后，*層調水不宜過急，噴水應在早、晚天氣陰涼時進行，同時加大菇房通風，降低空氣相對濕度。 3、要立即重新覆*，并適當多噴些水，促使菌絲及時結成子實體，也可在小菇蕾形成之前把覆*表面輕輕耙破，并增加通風量，減少相對濕度。
      地蕾菇（頂泥菇）
      癥狀：主要出現在出菇初期，子實體著生部位低，通常在培養料內、料表或粗*層下部發生，長大后破*頂泥而出。 
      發生原因： 1、培養料內混有泥*或覆*層干濕不均，當料內溫度、濕度和空氣條件適宜子實體生長時，就會導致菌絲圍繞泥*扭結變粗形成原基。原基分化后向上生長即頂泥而出，若向上條件不適，還會掉頭向床下生長形成床底菇。 2、粗*調水時間過長，調水后菇房通風過多、菇房溫度降低都會抑制菌絲向粗*內生長，促使結菇過早；細*覆蓋過遲、過厚，調水不及時，調水過快、過急或調水后通風時間過長，*層濕度不夠，菌絲遲遲不上細*，都會壓低出菇部位。 3、結菇噴水過早、過急或噴水量過大，會抑制*層菌絲向上生長，迫使菌絲在粗*粒之間扭結，從而降低出菇部位，造成出菇稀、結菇部位不正常，地蕾菇增多。       預防措施： 1、鋪培養料時，應揀凈料內混入的*塊。 2、覆*要均勻，盡量在粗*層尚未形成小菌蕾時覆蓋細*。 3、*層調水要均勻，并適當通風，調水后要減少通風。 4、在*層菌絲培養階段要控制好菇房溫度，防止溫度偏低，并保持一定的空氣相對濕度（85％左右），促使菌絲向*層內生長，吊高菌絲生長部位，適時適量噴好結菇水，防止結菇早、結菇部位過低。  
      空根白心菇  癥狀：蘑菇菌柄組織不充實，內部出現白色疏松的髓部，菇體干燥后或煮熟后髓部收縮或脫落成中空狀。  發生原因：主要是由于水分管理不當，如果菇房空氣濕度低、*層濕度小，尤其是粗*層含水量不足，正在迅速生長的子實體便不能從*層中得到充足的水分，進而營養的輸送補給也會減少，加上菇體自身水分不斷蒸發，就會造成菌柄中間缺水、組織不緊密，從而產生空根白心的現象。 
      預防措施： 
      1、粗*調水以及噴灑結菇水和出菇水時，水量要充足，防止*粒出現假濕。 2、出菇后要盡量噴一次出菇水，以保證粗*層在整個出菇盛期能夠不斷地得到水分的補充。 3、長菇階段要經常在菇房內噴霧增濕，菇房空氣相對濕度要達到90％。氣溫較高時，應在早晚或夜間通風降溫，以防止水分散失過快。 
      硬開傘 
      癥狀：蘑菇子實體在尚未成熟時菌蓋與菌柄就分離裂開，并裸露出淡紅色的菌褶。 
      發生原因：主要是由于氣溫變化急劇（溫度在18攝氏度以下，溫差在10攝氏度左右），造成料溫、*層溫度與氣溫之間的溫度反差，菇柄的營養代謝與生理代謝發生紊亂，使扎根于*層內的菌柄和暴露于*層表面的菌蓋因生長不平衡而發生開裂。 預防措施：加強菇房內的保溫措施，夜間不宜通風，不讓冷風吹進菇房。同時，調節好空氣相對濕度，促進菇體各部位均衡生長。  
      薄皮早開傘 
      癥狀：子實體柄細蓋薄，提早開傘。 發生原因：出菇密度過大，菇房溫度偏高，空氣相對濕度不夠，床面*層偏干，子實體生長快等，都會形成薄皮早開傘。 預防措施：適當控制出菇部位，菇房通風時間宜選在早、晚，降低菇房溫度，適當增加床面*層水分和空氣相對濕度。