【作者】李帆 陳利 丁艾 柳英 劉云超 閆苗 孫淑靜

【機構】福建農林大學生命科學學院福建農林大學(古田)菌業研究院

摘要：為了探討刺芹側耳子實體生長發育時期的基因表達變化,本文利用高通量測序技術對刺芹側耳不同發育時期(菌絲期、原基期、子實體時期)進行RNA-Seq分析,在轉錄水平上解析差異表達基因在刺芹側耳生長發育過程中的作用和功能。KEGG功能富集顯示,菌絲期差異表達基因主要富集在碳代謝和氨基酸代謝中,其中三羧酸循環中編碼檸檬酸合酶、烏頭酸水合酶、異檸檬酸脫氫酶、琥珀酰輔酶A合成酶、琥珀酸脫氫酶、蘋果酸脫氫酶的基因表達量均上調,說明碳代謝和氨基酸代謝是菌絲時期的主要能量來源;原基期上調的差異表達基因主要富集在脂肪酸代謝,其中RT-PCR定量結果顯示原基期編碼脂肪酸合酶的基因和編碼脂酰輔酶A合成酶的基因下調,編碼超氧化物酶的基因和編碼過氧化氫酶的基因上調,表明脂肪酸代謝和抗氧化酶對刺芹側耳原基期維持機體的穩定和生物應激方面起著重要作用。子實體時期上調的差異表達基因主要富集在剪接體、類固醇的生物合成以及AMPK信號通路中,說明環境因子對子實體時期有一定的影響。 

 

基金：福建省科技廳星火計劃(2016S0041)； 校科技創新專項基金(KFA17576A)； 福建省食用菌產業重大研發平臺(2014N2101)~~；

 

關鍵詞：刺芹側耳; 比較轉錄組學; 不同生長發育時期; 差異表達基因; 代謝途徑;