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    冬蟲夏草不同發(fā)育時期蛋白質(zhì)組iTRAQ質(zhì)譜分析


    【發(fā)布日期】:2019-01-22  【來源】:菌物學(xué)報
    【作者】張晗星 錢正明 蘇堯 劉杏忠 李文佳 董彩虹
    【機(jī)構(gòu)】中國科學(xué)院微生物研究所真菌學(xué)國家重點(diǎn)實驗室廣東東陽光藥業(yè)有限公司國家中醫(yī)藥管理局重點(diǎn)研究室宜昌山城水都冬蟲夏草有限公司
    【摘要】本文選定冬蟲夏草寄主昆蟲幼蟲(S1)、僵蟲(S2)、子座初期(子座<1cm,S3)、子座早期(1cm<子座<3cm,S4)、成熟冬蟲夏草(子座>7cm,S5)、商品冬蟲夏草菌核(S6)、商品冬蟲夏草子座(S7)及商品冬蟲夏草(中期子座≈5cm,S8)8個樣品,用定量蛋白質(zhì)組學(xué)方法 i TRAQ分析技術(shù)對冬蟲夏草不同生長發(fā)育階段的差異蛋白質(zhì)組進(jìn)行比較。共計獲得9 924個不同肽段,鑒定到1 809個蛋白質(zhì),其中差異比值1.5倍以上,P<0.05蛋白個數(shù)506個,以商品冬蟲夏草樣本(S8)為參照,比較差異蛋白數(shù)量,寄主幼蟲(S1)、僵蟲(S2)、子座初期(S3)、子座早期(S4)、成熟冬蟲夏草(S5)、商品冬蟲夏草菌核(S6)及商品冬蟲夏草子座(S7)階段差異蛋白數(shù)分別為104、102、34、35、49、46和136個,說明昆蟲幼蟲、僵蟲及子座與商品冬蟲夏草樣品差異顯著。對鑒定蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)進(jìn)行了主成分分析(principal component analysis,PCA),在第三主成分(component 3)上的顯著差異,表明成熟冬蟲夏草(S5)的蛋白組成不同于商品蟲草,說明成熟蟲草品質(zhì)下降。層次聚類(hierarchy clustering)分析結(jié)果表明所有樣品分為兩支,僵蟲(S2)和商品冬蟲夏草菌核(S6)與寄主幼蟲(S1)聚在了一個分支上,而不同發(fā)育階段樣品(S3、S4和S5)與商品蟲草子座(S7)聚在一個分支上,說明商品冬蟲夏草菌核中還殘留有寄主昆蟲蛋白。冬蟲夏草菌核部位的蛋白到子座部位的蛋白呈現(xiàn)由寄主幼蟲蛋白向真菌蛋白發(fā)育過渡的聚類關(guān)系。子集嵌套關(guān)系同步子實體生長發(fā)育階段蛋白組成變化隨時間的程序性變化的規(guī)律。K-均值(K-means)聚類和Gene ontology(GO)注釋分析,提供了冬蟲夏草成熟過程中能量代謝通路的變化趨勢以及與真菌侵染昆蟲和有性生殖相關(guān)蛋白質(zhì)信息。研究結(jié)果為理解寄主昆蟲對冬蟲夏草功能的潛在貢獻(xiàn)、子實體形成和發(fā)育的分子機(jī)制提供借鑒,并為蛋白質(zhì)組作為冬蟲夏草質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)提供了科學(xué)參考。
    【基金】國家自然科學(xué)基金(31572179); 山西省煤基重點(diǎn)科技攻關(guān)項目設(shè)施食用菌高效碳循環(huán)研究與示范(FT2014-03-01)~~;
    【關(guān)鍵詞】冬蟲夏草; 蛋白質(zhì)組; i TRAQ; 二維液相色譜串聯(lián)質(zhì)譜; 生物信息學(xué);
     
     
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