【作者】代永東 虞泓 陳自宏 楊俊媛
【機構】云南大學中草藥生物資源研究所云百草實驗室
【摘要】對云南粉棒束孢8個當地居群和蝙蝠蛾擬青霉2個當地居群進行ITS測序和RAPD擴增分析,結合Gen Bank中相關序列,對粉棒束孢開展遺傳多樣性、居群遺傳結構及其種內分化研究。共獲得大范圍內地理距離遠的6個居群共97條粉棒束孢ITS序列,共有33種單倍型,單倍型多樣性Hd=0.546和總核苷酸多樣性Pi=0.00276,顯示粉棒束孢在物種水平上遺傳多樣性較低。云南粉棒束孢共37條序列,有14種單倍型(10種為云南特有),具有較高單倍型多樣性和核苷酸多樣性(Hd=0.659,Pi=0.00274);單倍型聚類和網狀分支分析表明云南粉棒束孢單倍型類型豐富,遺傳多樣性高,暗示云南為粉棒束孢多樣性分布中心之一。ITS序列分析表明,云南當地居群間遺傳分化系數Fst=51.95%;RAPD分析表明,居群間遺傳分化系數Gst=0.5547,基因流Nm=0.4014;說明云南當地居群粉棒束孢分化劇烈。居群遺傳距離與地理距離相關性研究表明,粉棒束孢居群遺傳距離與地理距離無明顯相關。中性檢驗和失配分析表明粉棒束孢經歷過近期居群擴張。結合單倍型聚類和網狀分支分析,表明Hap 19為擴張建群單倍型,但原始祖先單倍型(Hap 1)依然是粉棒束孢居群中最優勢單倍型(頻率為48.45%),表明粉棒束孢并不存在明顯的因地理原因造成的生殖隔離。值得重視的是,通過ITS單倍型和RAPD分析,支持將蝙蝠蛾擬青霉作為粉棒束孢異名處理。
【基金】國家教育部博士點基金項目《冬蟲夏草復合體居群DNA序列生態地理變異式樣研究》(20125301110001); 國家火炬計劃產業化示范項目《云南云百草牌蟲草系列產品產業化》(2013GH021540); 云南省科技計劃民營經濟發展專項資金項目《云南蟲草生物資源可持續產業化開發》(2014XA051);
【關鍵詞】ITS序列分析; RAPD擴增分析; 單倍型; 居群擴張; 相關性;
【機構】云南大學中草藥生物資源研究所云百草實驗室
【摘要】對云南粉棒束孢8個當地居群和蝙蝠蛾擬青霉2個當地居群進行ITS測序和RAPD擴增分析,結合Gen Bank中相關序列,對粉棒束孢開展遺傳多樣性、居群遺傳結構及其種內分化研究。共獲得大范圍內地理距離遠的6個居群共97條粉棒束孢ITS序列,共有33種單倍型,單倍型多樣性Hd=0.546和總核苷酸多樣性Pi=0.00276,顯示粉棒束孢在物種水平上遺傳多樣性較低。云南粉棒束孢共37條序列,有14種單倍型(10種為云南特有),具有較高單倍型多樣性和核苷酸多樣性(Hd=0.659,Pi=0.00274);單倍型聚類和網狀分支分析表明云南粉棒束孢單倍型類型豐富,遺傳多樣性高,暗示云南為粉棒束孢多樣性分布中心之一。ITS序列分析表明,云南當地居群間遺傳分化系數Fst=51.95%;RAPD分析表明,居群間遺傳分化系數Gst=0.5547,基因流Nm=0.4014;說明云南當地居群粉棒束孢分化劇烈。居群遺傳距離與地理距離相關性研究表明,粉棒束孢居群遺傳距離與地理距離無明顯相關。中性檢驗和失配分析表明粉棒束孢經歷過近期居群擴張。結合單倍型聚類和網狀分支分析,表明Hap 19為擴張建群單倍型,但原始祖先單倍型(Hap 1)依然是粉棒束孢居群中最優勢單倍型(頻率為48.45%),表明粉棒束孢并不存在明顯的因地理原因造成的生殖隔離。值得重視的是,通過ITS單倍型和RAPD分析,支持將蝙蝠蛾擬青霉作為粉棒束孢異名處理。
【基金】國家教育部博士點基金項目《冬蟲夏草復合體居群DNA序列生態地理變異式樣研究》(20125301110001); 國家火炬計劃產業化示范項目《云南云百草牌蟲草系列產品產業化》(2013GH021540); 云南省科技計劃民營經濟發展專項資金項目《云南蟲草生物資源可持續產業化開發》(2014XA051);
【關鍵詞】ITS序列分析; RAPD擴增分析; 單倍型; 居群擴張; 相關性;