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    核糖體RNA二級結構對拓撲結構準確性的影響(英文)


    【發布日期】:2019-01-15  【來源】:菌物學報
    【作者】劉超洋 莊文穎
    【機構】西南科技大學生命科學與技術學院中國科學院微生物研究所真菌學國家重點實驗室(籌)
    【摘要】探討了核糖體小亞基二級結構對真菌系統發育分析的影響。對用不同方法構建的系統發育樹進行比較,結果表明結合二級結構信息的分析方法較傳統方法產生了更為合理的拓撲結構。二級結構信息除用于優化序列比對外,還需整合到核酸替代模型中;恰當的序列比對方法、進化模型和建樹運算法則有助于更加準確地揭示類群之間的親緣關系。 
    【基金】Supported by the Talent Grant of Southwest University of Science and Technology to CYL; the National Natural Science Foundation of China (No. 31070015); the Knowledge Innovation Program of the Chinese Academy of Sciences (No. KSCX2-EW-J-6) to WYZ;
    【關鍵詞】系統發育; 序列分析; 拓撲結構;
     
     
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