一、生產成本
1.消耗性原料和材料。原料主要指生產用的各種培養料，如木屑、棉子殼、麥麩、石膏等；材料主要是各種包裝物等，如玻璃瓶、塑料袋等。在選擇栽培種類時，生產原料來源是否方便可靠是重要因素。如平原地區應選擇以秸稈、皮殼為主料的栽培種類，如平菇、雙孢菇等；林區則宜選擇以木屑為主料的種類，如黑木耳、香菇等。生產原料大都是農林副產品，價格低廉，若不就地取材，則運輸成本大增。生產用材料多工業化生產，不同地區價格差別不大，但切勿貪圖便宜購用次品。
2.能耗。多數食用菌都需滅菌進行熟料栽培，需要熱能的能耗成本。合理選擇與使用滅菌器械和熱源，科學設計滅菌灶柜，實行培養料發酵預處理等措施能大大降低能耗成本。
3.運輸成本。主要指產品到市場間的運輸成本。不同的產品形式，不同品種，不同的市場距離，運輸成本大不相同。相對而言，干品運輸成本低，鮮品運輸成本高，耐貯藏耐運輸的品種運輸成本低，相反則高。
4.過程成本。食用菌生產是勞動密集型產業，從開始生產到產出成品，較工業生產周期長得多，過程成本的可塑性較強，減少過程，簡化過程，可有效地提高成品率，增加效益。過程成本主要在于物品的傳遞和轉移，應盡量減少。
5.人工費。我國食用菌生產一直以手工操作為主，降低勞工成本主要在于技術路線合理，設備設施及場所配套合理、器械和用具適宜，勞動者技術熟練和行之有效的管理。
6.管理成本。作為企業規模化生產，管理水平越高的企業管理成本比例越低。我國食用菌企業的管理水平亟待提高。
7.固定設施折舊。包括廠房、菇房（棚）、室內設施、場地、基本建設投資等。
二、售價
不同層面的市場售價不同，零售市場是產品的最終市場，但作為生產者，除小農式庭院生產外，做不到完全直接零售，絕大多數生產者只能得到出廠批發價。
1.市場層面。不同市場層面，對產品的要求不同，包括品質和數量，同是金針菇，如果直接銷往賓館，要求整齊均勻、供貨數量穩定，價格高。農產生產多銷往普通菜市場，對品質要求較松，數量上也無嚴格限制，價格也低。
2.供求關系。不同季節食用菌的供求關系不同，一般在自然條件較適宜的春秋季產品多，而夏冬季產品少，但恰恰是這兩個季節價格高。近年栽培技術較好的菇農看準了這一市場變化規律，想方設法夏季降溫出菇，冬季增溫增產，取得了較好的經濟效益。
