1、菇蠅：幼蟲又稱菌蛆，主要取食子實體造成隧道而影響品質，且造成的傷口還很易被病菌感染而腐爛。防治菇蠅在不同時期應采用不同方法。此菇前有菌蛆大量發生，可用敵敵畏按0.90千克/100平方米的量進行熏蒸，同時在每個培養塊上再噴0.15千克的1%氯化鉀或氯化鈉溶液（可用5%食鹽水代替）；出菇后有菌蛆為害可噴魚藤精、除蟲菌酯，煙堿等低毒農藥。（煙堿可自制：取0.50千克煙梗，加水5千克煮沸后取溶液噴灑）。此外還應加強通風，調節棚內溫濕度來惡化害蟲生存環境，達到防治其為害的目的。
2、菇蚊：菇蚊以幼蟲期為害最大，除在培養料表面蛀食外，有的還結網罩住菇蕾，使菇體不能正常生長。防治方法：采收后噴500—800倍的敵百蟲，同時在菇棚門和窗口處還要加上尼龍紗以防成蟲飛入產卵、繁殖為害。
3、菌虱：是一種螨類，個體很小，爬行較快，主要取食子實體和菌絲造成危害。防治時首先應杜絕蟲源浸入菇棚，因其主要來源于倉庫、飼料間的各種飼料里，所以利用倉庫，雞舍等作為養菌室時要徹底消毒，并用石灰刷墻，使用前再用敵敵畏熏蒸1次；培養期間發現菌虱可用棉球沾50%敵敵畏懸掛熏蒸或噴施1%硫酸尼古丁溶液，也可用豬骨頭等帶腥味的東西噴上亞硫磷等農藥后放在培養塊附近，把菌虱引誘上去，再取出后燒掉或用開水燙死。
4、線蟲：線蟲是一種無色的小蠕蟲，體形極小，僅1毫米左右。幼蟲侵害菌絲體和子實體，開始時菌蓋變黑，以后整個子實體全變黑腐爛并有霉臭味。防治方法：蒸料時要使蒸汽充分接觸培養料，以殺死全部線蟲。出菇后，可用50毫克/千克的硫化鋅噴施培養塊來防治其為害。
