（1）侵害食用菌的病蟲種類繁多。據初步統計，對培養料、菌絲體和菇體造成直接侵害的病原菌有真菌、細菌、病毒等100多個種類。非侵染性種類有10多種。在蟲害方面有15個目的昆蟲能直接侵害食用菌的菌絲和子實體，種類達46種以上。
　　（2）營養豐富的栽培基質，為病蟲繁殖提供了良好的食源。許多害蟲和病菌以腐熟的有機質為食源，如跳蟲、螨蟲、癭蚊、線蟲、白蟻和蚤蠅等昆蟲都喜食腐熟潮濕的有機質。經發酵熟化后用于栽培蘑菇、草菇和雞腿蘑的基質能散發出特有的氣味，吸引昆蟲成蟲在料里產卵。
　　（3）適宜的出菇環境，也為病蟲繁殖提供了優越的條件。絕大多數種類的食用菌發菌溫度在20~26℃，出菇溫度在10~25℃，培養基內水分在65%左右，出菇場所空氣濕度在85%以上。與此同時，也適合病蟲生活的條件，病蟲繁殖和為害的速度也達到最快值。
　　（4）食用菌與病菌在生理特性上差異性小，生理性較一致。許多殺菌藥易傷害菌絲和菇體，引起藥害。
　　（5）培養基質攜帶病蟲源。絕大多數的致病菌和有害昆蟲，其寄主都是有機質。例稻草、棉籽殼，另外禽畜糞便本身就攜帶大量病菌孢子、菌體、螨蟲和蚊蠅等蟲卵。　　
　　（6）病蟲同時侵入、交叉感染。菇蚊、菇蠅身上攜帶螨蟲和病菌，當其在培養基和菇體上取食和產卵時就傳播病毒、螨蟲和病菌。