蘑菇銹斑病又叫褐斑病，細菌性斑點病。其病原菌是一種嗜酸性的假單孢菌屬的托蘭斯假單孢菌。經昆蟲、器具、工作人員的手等媒介進行傳播。在菇床覆土pH值5．5以下，通風不良，濕度過高，噴水后菌蓋始終粘濕的情況下發病嚴重。

其癥狀是：一般只侵染蘑菇菌蓋的表皮層，使其起初出現黃褐色似鐵銹狀大小不一的斑點，后來逐漸變成褐色或黑色，有時菌蓋上還會出現帶黏液的疤痕。此病蔓延迅速，感染輕微時菇形正常，嚴重時菇蓋出現的凹斑多達數百個或病斑擴大呈條紋狀，子實體畸形。菌柄有時受感染也發生縱向凹斑。
防治的方法：

(1)覆土時把土層的pH值調到6．5―8，培養時加強通風。

(2)發病嚴重時，控制菇房溫、濕度。并用0．04％土霉素和0．04％鏈霉素向菇床隔日各噴一次。其后的菇床噴水應將pH值調到8，直至土層的pH值保持在6．5―7．5。

(3)在覆土層表面薄薄地撒上一層生石灰粉，也能有效地控制病情發展。